从湖底开始的水生群落的演替，属原生演替类型。现以淡水池塘或湖泊演替为例，其演替过程包括以下几个阶段：
(1)自由漂浮植物阶段 主要表现为有机质的沉积。由于沿岸植物深入到池中，池中的浮游植物和其它生物 的生命活动所产生的有机物在池底沉积起来，天长日久，使湖底逐渐抬高。
(2)沉水植物阶段 在水深57米处，出现的沉水的轮藻属(Chara)植物，构成湖底裸地上的先锋植物群落。
由于它的生长，湖底有机质积累较快而多，同时它们的残体在嫌气条件下，分解不完全，湖底进一步抬高。继而金鱼藻(Ceratophy llum)、狐尾藻(Myriophyllum)等高等水生植物种类出现，它们生长繁殖能力强，垫高湖底的作用能力更强。鱼类等典型的水生动物减少，而两栖类和水蛭等动物增多。
(3)浮叶根生植物阶段 随着湖底变浅，浮叶根生植物出现，如眼子菜属(Potamogeton)、睡莲属(Nymphaea)、荇菜属(Nymphoides)等。它们的宽阔叶子在水面上形成连续不断覆盖，使得光照条件不利于沉水植物。这些植物死亡的组织具有较丰富的物质，腐败较缓慢，加速池底的抬高过程。
(4)挺水植物阶段 水体继续变浅，挺水植物如芦苇(Phragmites)、香蒲(Typha)、白菖(Acorus)等的出现，它们根茎极为茂密，常纠结在一起，不仅使池底迅速抬高，而且还可以形成一些浮岛。开始出现一些陆生环境的一些特征。这一阶段鱼类进一步减少，而两栖类和水生昆虫进一步增加。
(5)湿生草本植物阶段 湖水中升起的地面，含有极丰富的有机质，土壤水分近于饱和。湿生的沼泽植物开始生长，如莎草(Cyperus)、苔草(Carex)、蔗草(Scirpus)等属的一些种类组成。由于地面蒸发和地下水位下降，土壤很快变得干燥，湿生的草类很快为旱生草类所代替。
(6)木本植物阶段 在湿生草本植物群落中，首先出现湿性灌木，继而乔木侵入逐渐形成森林。原有的湿生生境，逐渐改变为中生生境。群落内的动物种类也逐渐增多，脊椎动物和无脊椎动物，以及微生物等均有分布，尤其是大型经济兽类，以森林为隐蔽所，赖以生存和繁衍。
整个水生演替系列也就是湖泊填平过程，它通常是从湖泊周围向湖泊中央而顺序发生的。演替的每一
阶段都为下一阶段创造了条件。使得新的群落得以在原有群落的基础上形成和产生。
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